Секретный фарватер

События сериала «Секретный фарватер» переносят зрителей в 1944 год и знакомят с командиром торпедного катера Борисом Шубиным. Его судно патрулирует воды Балтийского моря, рейд проходит без происшествий. Неожиданно герой замечает в воде странное свечение. Оно похоже на цепочку загорающихся одновременно огней.
Кроме него никто этого не видит, а потому слова Шубина подвергают сомнению. Но сам командир никак не может выбросить увиденное из головы. Скоро по воле случая он оказывается на борту немецкой лодки, носящей название «Летучий голландец». С этой таинственной субмариной так или иначе будет связана вся его дальнейшая жизнь.